Enstitümüz 03/07/1992 gün ve 3837 sayılı Kanun ile Marmara Üniversitesi Rektörlüğü'ne
bağlı olarak Prof. Şermin ALYANAK'ın başkanlığında kurulmuştur.

16 Şubat 1999-16 Eylül 2004 tarihleri arasında  da Enstitümüz Müdürlüğü Prof. Dr. Feryal İREZ tarafından yürütülmüştür.

2004-2010 yılları arasında Enstitü Müdürlüğü'nü Prof. Bülent VARDAR yürütmüştür.

02.07.2010 - 01.07.2016 tarihleri arasında Prof. Nilüfer ERGİN DOĞRUER yürütmüştür.

01.07.2016 - 06.03.2021 tarihleri arasında Prof. Oktay ÇOLAK yürütmüştür.

06.03.2021 tarihinde Prof. Dr. Osman ÜRPER Enstitü Müdürlüğü görevine atanmıştır.